MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446 chromosome

Total Repeats: 67804

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_013205	CGT	2	6	104365	104370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510102
2502	NC_013205	GCC	2	6	104372	104377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510102
2503	NC_013205	GC	3	6	104380	104385	0 %	0 %	50 %	50 %	258510102
2504	NC_013205	GCG	2	6	104415	104420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510102
2505	NC_013205	GCG	2	6	104424	104429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510102
2506	NC_013205	TCG	2	6	104433	104438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510102
2507	NC_013205	GAC	2	6	104459	104464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510102
2508	NC_013205	TCG	2	6	104496	104501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510102
2509	NC_013205	CAG	2	6	104522	104527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510102
2510	NC_013205	GCG	2	6	104551	104556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510102
2511	NC_013205	CAG	2	6	104561	104566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510102
2512	NC_013205	GCG	2	6	104567	104572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510102
2513	NC_013205	TCG	2	6	104603	104608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510102
2514	NC_013205	T	6	6	104612	104617	0 %	100 %	0 %	0 %	258510102
2515	NC_013205	CGT	2	6	104679	104684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510102
2516	NC_013205	CGA	2	6	104689	104694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510102
2517	NC_013205	GC	4	8	104725	104732	0 %	0 %	50 %	50 %	258510102
2518	NC_013205	CTA	2	6	104746	104751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510102
2519	NC_013205	CGT	2	6	104772	104777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510102
2520	NC_013205	CGG	2	6	104839	104844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510102
2521	NC_013205	CTC	2	6	104891	104896	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258510102
2522	NC_013205	CAG	2	6	104960	104965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510102
2523	NC_013205	CGT	2	6	104968	104973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510102
2524	NC_013205	CGA	3	9	104980	104988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510102
2525	NC_013205	CTC	2	6	104999	105004	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258510102
2526	NC_013205	CGGC	2	8	105015	105022	0 %	0 %	50 %	50 %	258510102
2527	NC_013205	GC	3	6	105049	105054	0 %	0 %	50 %	50 %	258510102
2528	NC_013205	CG	3	6	105091	105096	0 %	0 %	50 %	50 %	258510102
2529	NC_013205	ACA	2	6	105171	105176	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258510102
2530	NC_013205	TCG	3	9	105228	105236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510102
2531	NC_013205	GGCG	2	8	105271	105278	0 %	0 %	75 %	25 %	258510102
2532	NC_013205	CGC	2	6	105363	105368	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510102
2533	NC_013205	TGG	2	6	105390	105395	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510102
2534	NC_013205	CGAC	2	8	105417	105424	25 %	0 %	25 %	50 %	258510102
2535	NC_013205	GGC	2	6	105430	105435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510102
2536	NC_013205	AGG	2	6	105489	105494	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510102
2537	NC_013205	CGA	2	6	105526	105531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510102
2538	NC_013205	GC	3	6	105589	105594	0 %	0 %	50 %	50 %	258510102
2539	NC_013205	CAAGCG	2	12	105610	105621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510102
2540	NC_013205	AGG	3	9	105645	105653	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510102
2541	NC_013205	GCT	2	6	105661	105666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510102
2542	NC_013205	CGCTT	2	10	105720	105729	0 %	40 %	20 %	40 %	258510102
2543	NC_013205	CGG	2	6	105738	105743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510102
2544	NC_013205	GGC	2	6	105769	105774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510102
2545	NC_013205	CCG	2	6	105782	105787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510102
2546	NC_013205	GGA	2	6	105802	105807	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510102
2547	NC_013205	GCC	2	6	105822	105827	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510102
2548	NC_013205	CG	3	6	105911	105916	0 %	0 %	50 %	50 %	258510102
2549	NC_013205	GC	3	6	105921	105926	0 %	0 %	50 %	50 %	258510102
2550	NC_013205	TGG	2	6	105942	105947	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510102
2551	NC_013205	ACT	2	6	105960	105965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510102
2552	NC_013205	AGC	2	6	106035	106040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510102
2553	NC_013205	GAG	2	6	106070	106075	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510102
2554	NC_013205	CG	3	6	106161	106166	0 %	0 %	50 %	50 %	258510102
2555	NC_013205	GC	3	6	106212	106217	0 %	0 %	50 %	50 %	258510102
2556	NC_013205	GCA	2	6	106249	106254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510102
2557	NC_013205	GGCG	2	8	106255	106262	0 %	0 %	75 %	25 %	258510102
2558	NC_013205	CG	3	6	106267	106272	0 %	0 %	50 %	50 %	258510102
2559	NC_013205	GAC	2	6	106306	106311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510102
2560	NC_013205	GC	3	6	106399	106404	0 %	0 %	50 %	50 %	258510102
2561	NC_013205	CGT	2	6	106423	106428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510102
2562	NC_013205	TCG	2	6	106476	106481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510102
2563	NC_013205	CTG	2	6	106526	106531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510102
2564	NC_013205	CG	4	8	106545	106552	0 %	0 %	50 %	50 %	258510102
2565	NC_013205	GCGAG	2	10	106581	106590	20 %	0 %	60 %	20 %	258510102
2566	NC_013205	TC	3	6	106600	106605	0 %	50 %	0 %	50 %	258510102
2567	NC_013205	CGC	2	6	106636	106641	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510102
2568	NC_013205	ATCT	2	8	106663	106670	25 %	50 %	0 %	25 %	258510103
2569	NC_013205	GCA	2	6	106755	106760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510103
2570	NC_013205	CGC	2	6	106765	106770	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510103
2571	NC_013205	CG	3	6	106773	106778	0 %	0 %	50 %	50 %	258510103
2572	NC_013205	CGG	2	6	106799	106804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510103
2573	NC_013205	TCG	2	6	106889	106894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510103
2574	NC_013205	CGCC	2	8	106992	106999	0 %	0 %	25 %	75 %	258510103
2575	NC_013205	GGA	2	6	107001	107006	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510103
2576	NC_013205	GC	3	6	107008	107013	0 %	0 %	50 %	50 %	258510103
2577	NC_013205	CGG	2	6	107019	107024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510103
2578	NC_013205	GAC	2	6	107026	107031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510103
2579	NC_013205	AGG	2	6	107048	107053	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510103
2580	NC_013205	CGT	2	6	107073	107078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510103
2581	NC_013205	GC	3	6	107080	107085	0 %	0 %	50 %	50 %	258510103
2582	NC_013205	TCG	2	6	107108	107113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510103
2583	NC_013205	GCT	2	6	107133	107138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510103
2584	NC_013205	CG	3	6	107163	107168	0 %	0 %	50 %	50 %	258510103
2585	NC_013205	GCCT	2	8	107197	107204	0 %	25 %	25 %	50 %	258510103
2586	NC_013205	GAG	3	9	107224	107232	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510103
2587	NC_013205	CG	3	6	107303	107308	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2588	NC_013205	AGG	2	6	107343	107348	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2589	NC_013205	GAA	2	6	107398	107403	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258510104
2590	NC_013205	CGCGAT	2	12	107458	107469	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	258510104
2591	NC_013205	CGG	3	9	107498	107506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510104
2592	NC_013205	GC	3	6	107513	107518	0 %	0 %	50 %	50 %	258510104
2593	NC_013205	GCG	2	6	107542	107547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510104
2594	NC_013205	CG	3	6	107554	107559	0 %	0 %	50 %	50 %	258510104
2595	NC_013205	GTC	2	6	107575	107580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510104
2596	NC_013205	ATTGGC	2	12	107581	107592	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	258510104
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2599	NC_013205	GGA	2	6	107832	107837	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510104
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2601	NC_013205	GAC	2	6	107932	107937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510104
2602	NC_013205	CGG	2	6	107940	107945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510104
2603	NC_013205	CGG	2	6	107963	107968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510104
2604	NC_013205	ATC	2	6	108068	108073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258510104
2605	NC_013205	CGG	2	6	108074	108079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510104
2606	NC_013205	GC	3	6	108094	108099	0 %	0 %	50 %	50 %	258510104
2607	NC_013205	CAG	2	6	108112	108117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510104
2608	NC_013205	CG	3	6	108152	108157	0 %	0 %	50 %	50 %	258510104
2609	NC_013205	TGG	2	6	108175	108180	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510104
2610	NC_013205	CAG	2	6	108181	108186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510104
2611	NC_013205	TGC	2	6	108236	108241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510104
2612	NC_013205	ACG	2	6	108247	108252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510104
2613	NC_013205	CG	3	6	108285	108290	0 %	0 %	50 %	50 %	258510104
2614	NC_013205	GTG	2	6	108346	108351	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510104
2615	NC_013205	CG	3	6	108353	108358	0 %	0 %	50 %	50 %	258510104
2616	NC_013205	AGG	2	6	108410	108415	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510104
2617	NC_013205	TGG	2	6	108434	108439	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510104
2618	NC_013205	CTT	2	6	108519	108524	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258510104
2619	NC_013205	G	6	6	108544	108549	0 %	0 %	100 %	0 %	258510104
2620	NC_013205	GGC	2	6	108687	108692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510105
2621	NC_013205	TGG	2	6	108736	108741	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510105
2622	NC_013205	CGTGG	2	10	108833	108842	0 %	20 %	60 %	20 %	258510105
2623	NC_013205	CGT	2	6	108848	108853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510105
2624	NC_013205	GGA	2	6	108905	108910	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510105
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2631	NC_013205	G	7	7	109272	109278	0 %	0 %	100 %	0 %	258510105
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2643	NC_013205	CTG	2	6	109715	109720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510106
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2731	NC_013205	CTGG	2	8	113306	113313	0 %	25 %	50 %	25 %	258510110
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2736	NC_013205	TCG	2	6	113473	113478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2737	NC_013205	CCT	2	6	113480	113485	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2738	NC_013205	TA	4	8	113503	113510	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2739	NC_013205	GC	3	6	113539	113544	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2740	NC_013205	GAG	2	6	113606	113611	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510111
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2742	NC_013205	GGA	2	6	113645	113650	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258510111
2743	NC_013205	A	6	6	113662	113667	100 %	0 %	0 %	0 %	258510111
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2745	NC_013205	GCT	2	6	113679	113684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258510111
2746	NC_013205	CGG	2	6	113710	113715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510111
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2750	NC_013205	GAT	2	6	113807	113812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258510111
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2752	NC_013205	CG	3	6	113958	113963	0 %	0 %	50 %	50 %	258510111
2753	NC_013205	AGC	2	6	114004	114009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258510111
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2762	NC_013205	AAG	2	6	114311	114316	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2765	NC_013205	TGG	2	6	114344	114349	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258510112
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2870	NC_013205	CG	3	6	118974	118979	0 %	0 %	50 %	50 %	258510117
2871	NC_013205	GC	3	6	119016	119021	0 %	0 %	50 %	50 %	258510117
2872	NC_013205	GCG	2	6	119108	119113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510117
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2882	NC_013205	ACC	2	6	119387	119392	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2883	NC_013205	CAT	2	6	119398	119403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2884	NC_013205	CG	3	6	119453	119458	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2885	NC_013205	CG	3	6	119489	119494	0 %	0 %	50 %	50 %	258510119
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2975	NC_013205	AC	3	6	123334	123339	50 %	0 %	0 %	50 %	258510123
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2991	NC_013205	GCG	2	6	124081	124086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510124
2992	NC_013205	GC	3	6	124211	124216	0 %	0 %	50 %	50 %	258510124
2993	NC_013205	CGC	2	6	124226	124231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258510124
2994	NC_013205	GCGG	2	8	124259	124266	0 %	0 %	75 %	25 %	258510124
2995	NC_013205	CGAGAT	2	12	124277	124288	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	258510124
2996	NC_013205	GCG	2	6	124374	124379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510124
2997	NC_013205	GCG	2	6	124420	124425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510124
2998	NC_013205	GC	4	8	124479	124486	0 %	0 %	50 %	50 %	258510124
2999	NC_013205	CCA	2	6	124527	124532	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258510124
3000	NC_013205	GGC	2	6	124536	124541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258510124

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